Shiki Toono se despierta en la sala de un hospital con la capacidad de ver líneas invisibles. Estos finos hilos, que componen toda la materia en Shingetsutan, destruyen instantáneamente un objeto cuando se cortan. Shiki descubre que si traza las líneas de algo, pronto se producirá su destrucción. Mientras mantiene en secreto su visión sobrenatural, Shiki procede a vivir su vida de segundo año en paz. Sin embargo, esta paz dura poco cuando Shiki se encuentra con una mujer misteriosa con ojos rojos brillantes en su camino de regreso de la escuela. Después de un repentino lapso psicótico, parece matar a la mujer y se desmaya poco después. Como si las cosas no pudieran empeorar, Shiki es atacada por un par de perros demoníacos al día siguiente; al enfrentarse a una muerte segura, Shiki se salva con la llegada oportuna de la misma mujer de ayer. Se presenta como Arcueid Brunestud, una princesa vampira. Shiki y Arcueid deciden formar equipo y se embarcan en un viaje para descubrir la verdad detrás de su linaje y la reciente serie de asesinatos en la ciudad. [Escrito por MAL Rewrite]