El sargento Sousuke Sagara regresa a la escuela secundaria Jindai para proteger al preciado activo de guerra, Kaname Chidori, de cualquier amenaza. Sin embargo, su falta de habilidades sociales y experiencia en la vida real resultan en situaciones cómicas pero peligrosas, poniendo en peligro la vida escolar pacífica que Kaname anhela. Mientras Sousuke continúa trayendo una amplia gama de armas a la escuela como un medio para resolver amenazas, reales o falsas, Kaname lucha por cumplir con su deber como vicepresidenta del consejo estudiantil mientras lo mantiene bajo control. Para asegurar una misión exitosa, Sousuke se ve obligado ocasionalmente a usar el disfraz de una famosa mascota del parque de diversiones llamada Bonta-kun. Con su experiencia técnica, eventualmente transforma el exuberante uniforme en un exoesqueleto de vanguardia que tiene una sola disfunción: el traductor de voz solo puede producir el sonido “mofu”. Full Metal Panic? Fumoffu describe las aventuras de Kaname y Sousuke mientras intentan vivir sus vidas escolares normales a pesar del caos que causan inadvertidamente. [Escrito por MAL Rewrite]