Aunque ha pasado un año desde que se creó el Club de Natación de la Escuela Secundaria Iwatobi, aún no se han unido nuevos miembros al club. Ahora que Haruka Nanase y Makoto Tachibana son estudiantes de último año, junto con sus amigas más jóvenes Nagisa Hazuki y Rei Ryuugazaki, tienen que encontrar una manera de atraer nuevos miembros. Si no, el club se verá obligado a cerrar el año siguiente debido a la falta de miembros. Mientras tanto, con la inminente graduación, también es hora de que los estudiantes de último año decidan sus planes para el futuro. A diferencia de su amigo Rin Matsuoka, el nuevo capitán del Club de Natación de la Academia Samezuka, que está decidido a cumplir su sueño de ser un nadador profesional, Haruka y Makoto no están seguros de qué camino profesional quieren tomar. Surgen más problemas cuando un viejo amigo de Rin, Sousuke Yamazaki, llega a la ciudad para estudiar en la Academia Samezuka; la llegada del nadador recientemente descubierto causa tensión en la relación entre él, Rin y Haruka. [Escrito por MAL Rewrite]
